球棍模型是化学中常用的一种三维分子结构表示方法。在这个模型中，原子用球体表示，不同元素使用不同颜色区分（CPK颜色标准）；化学键用棍子（圆柱体）表示，连接相邻的原子。球棍模型能直观展示分子的三维几何构型、键角和相对位置，广泛应用于化学教学和科研可视化。单键用一根棍子表示，双键用两根平行棍子，三键用三根平行棍子。

CPK颜色标准由化学家Corey、Pauling和Koltun提出，用于在分子模型中统一标识不同元素。常见元素颜色：氢(H)白色、碳(C)深灰色、氮(N)蓝色、氧(O)红色、硫(S)黄色、磷(P)橙色、氯(Cl)绿色。这个标准使得化学家能够快速识别分子中的元素组成，被广泛应用于分子可视化软件和教材中。

旋转：鼠标左键拖拽或单指滑动（触屏）可旋转分子视角。
缩放：使用鼠标滚轮或双指捏合（触屏）可放大缩小分子。
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重置：点击"重置视角"按钮恢复到默认视角。
自动旋转：开启后分子将自动缓慢旋转，便于全方位观察。

当前查看器内置了多种代表性分子：水(H₂O)展示弯曲构型、二氧化碳(CO₂)展示线性结构、甲烷(CH₄)展示正四面体、氨(NH₃)展示三角锥、乙醇(C₂H₅OH)展示有机分子骨架、苯(C₆H₆)展示芳香环结构、咖啡因(C₈H₁₀N₄O₂)展示复杂杂环体系。这些分子涵盖了无机和有机化学中的典型结构类型。

在球棍模型中，单键由一根圆柱体连接两个原子；双键（如C=O）由两根平行的细棍表示，它们垂直于键轴并对称分布在两侧；三键（如N≡N）由三根平行的细棍表示。这种表示法直观地反映了键级信息。例如在苯分子中，碳环上的键交替显示为单键和双键（Kekulé结构），尽管实际上苯中的键是等价的离域键。